В ДНК людей нашли «призрачные» следы неизвестных популяций
Американские исследователи из Калифорнийского университета в Беркли создали метод, который позволяет находить в геномах современных людей следы ДНК вымерших человеческих групп, следует из результатов исследования, опубликованных в журнале Science. Благодаря ему ученые обнаружили генетическую информацию о ранее неизвестных древних популяциях человека.
Исследователи хотели понять, как гены далеких или же архаичных предков, таких как неандертальцы, денисовцы и другие, повлияли на современный вид Homo sapiens. Они решили изучить генетическую информацию, для чего разработали специальный метод анализа отслеживания архаичных вкладов в ДНК (TRacking Archaic Contributions via ARG Estimation, TRACE).
Ученые использовали особые графики, которые показывают, как менялись гены с течением времени, анализировали современные геномы людей со всего мира и применяли математические модели для определения участков ДНК, которые могли быть унаследованы от предков.
Для каждого участка генома анализировалась длина родовой ветви, которая ведет к современному образцу, и количество других событий слияния на дереве родословной в определенный временной промежуток. Они проанализировали более 500 геномов и обнаружили, что в ДНК современных людей есть фрагменты, указывающие на скрещивание с двумя линиями предков, которые до этого не были идентифицированы.
Обе линии исследователи охарактеризовали как «призрачные», то есть гипотетические древние популяции, чьи останки не нашли, но о существовании которых судят по следам в ДНК современных людей. Ученые считают, что эти открытия указывают на более сложную систему эволюции человека, и допускают существование других предков людей, помимо обнаруженных.
«TRACE выявляет известную интрогрессию неандертальцев и денисовцев, а также «призрачную» примесь от неидентифицированных гоминид как у африканцев, так и у представителей других популяций. «Призрачная» примесь сохраняется в местах обнаружения неандертальской и денисовской родословной, что ставит под сомнение интерпретацию этих регионов как Homo sapiens — специфичных», — отмечается в научной публикации.
Большинство участков генома современных людей имеют общего предка, жившего относительно недавно в истории эволюции, делится в интервью Live Science соавтор исследования Прия Мурджани, специалист по эволюционной генетике человека из Калифорнийского университета в Беркли. Однако есть случаи, когда обнаруживаются участки ДНК, указывающие на происхождение от давно разделившихся человеческих линий, продолжает ученый. Для этого и применяется метод TRACE.
«Нам больше не нужно ждать исключительной сохранности окаменелостей, чтобы узнать о вымерших человеческих популяциях. Вместо этого в геномах живых людей содержатся следы этих древних предков, и генеалогические методы позволяют нам восстановить часть этой скрытой истории», — отмечает Мурджани.
Раньше исследователи могли изучать только сохранившиеся окаменелости в холодных и сухих средах, теперь же ученые надеются использовать свой новый метод для обнаружения признаков других «призрачных» линий из Африки и Южной Азии. Более того, TRACE также может помочь в изучении эволюционной истории других видов, у которых ископаемая ДНК встречается редко или отсутствует, добавила Мурджани.
Ранее RTVI рассказывал о том, как ученые из Нидерландов разработали тест, позволяющий лучше изучать генетическую информацию для более эффективного выявления различных заболеваний.
